Pierwszy kościół w Świętajnie zbudowano w 1581 r., cztery lata po utworzeniu tutaj parafii ewangelickiej. Kościół, podobnie jak wiele w okolicy, został zniszczony w czasie najazdów tatarskich w XVII w.
Jednym z najtragiczniejszych wydarzeń w dziejach parafii była epidemia dżumy w latach 1709-1711. O rozmiarach epidemii w Świętajnie może świadczyć fakt, że na 38,5 włók ziemi aż 35 pozostawało pustych po przejściu zarazy. Podobnie też było w okolicznych włościach.
Wieś przez długie lata była zamieszkana wyłącznie przez ludność polskiego pochodzenia. W miejscowym kościele nabożeństwa odprawiano po polsku jeszcze na początku XX w. Tu w rodzinie pastorskiej urodził się ks. Marcin Zygmunt Zieleński (1649-1741), polski duszpasterz luterański w Królewcu i wydawca pism religijnych.
Kamienny mur i brama prowadząca na teren kościoła to pozostałość pomnika poświęconego mieszkańcom parafii Świętajno poległym w czasie I wojny światowej. Po II wojnie światowej kościół został przejęty przez parafię rzymsko-katolicką i gruntownie odrestaurowany.
Obecnie jest bardzo dobrze utrzymany.
Grafika z projektu www.egoturystyka.pl.